Mật Danh Kế Toán Cốt truyện xoay quanh Christian Wolff (Ben Affleck), một thiên tài toán học mắc chứng tự kỷ nặng. Dưới vỏ bọc nhân viên một công ty tầm thường, Christian thực chất là kế toán tự do làm việc cho nhiều tổ chức tội phạm khét tiếng nhất thế giới.
Anh đang bị Mạng lưới khống chế tội phạm tài chính thuộc Bộ ngân khố Hoa Kỳ vây bắt. Vừa phải lẩn trốn sự truy đuổi của cảnh sát, Christian Wolff vừa truy tìm câu trả lời cho số tiền thất thoát hàng chục triệu đô la của một công ty robot. Càng đi sâu, Christian càng phát hiện ra đây không phải là một vụ lừa đảo thông thường.